Dettagli del bando di gara
Stato
Data di presentazione
20/06/2018
Data della risposta
21/06/2018
Lingua
Stato
Risposto
Dettagli della domanda
Oggetto
Lotto 2: sequenziamento ITS
Domanda
Può l'offerente offrire primers migliori per sequenziare le regioni fungine ITS1 e ITS2 o i primers richiesti sono assolutamente obbligatori? È possibile proporre il sequenziamento ITS fungino come parte singola per migliorare lo scopo dell'annotazione tassonomica utilizzando qualsiasi altra piattaforma di sequenziamento ad alto rendimento alternativa?
Risposta
21/06/2018
L'utilizzo di una piattaforma di sequenziamento ad alto rendimento alternativa non è consentito. L'offerente deve utilizzare una piattaforma di sequenziamento ad alto rendimento singola, in quanto permette un paragone più accurato dei nostri dati con altri dataset continentali. Lo scopo dell'offerta non è di proporre primer sets alternativi, ma il servizio completo di analidi del DNA dall'estrazione al sequenziamento. La scelta dei primers non influisce sull'offerta. Il punto da considerare è che due set di primer sono utilizzati per ITS. In aggiunta, come descritto nelle specifiche tecniche (si veda sezione 2.2.4.1), durante l'esecuzione delle analisi, il contraente e il JRC possono discutere ogni potenziale questione relativa ad ogni passaggio (inclusa la scelta delle coppie di primer) delle analisi. Quindi, la possibile scelta di set di primer sarà discussa al momento opportuno.
21/06/2018
The aim of the offer is not to propose alternative primer sets, rather the overall service of DNA analysis from extraction to sequencing. The choice of primers does not affect the offer. The point to consider here is that two primer sets will be used for ITS. In addition, as reported in the Technical Specifications (see section 2.2.4.1), during the performance of the analysis, the contractor and the JRC can discuss any potential issues related to any step (included primer pair choice) of the analysis. Therefore, the possible change of primer sets will be discussed at the relevant time.